31 équipes de recherche sont associées à la MESHS au 1er janvier 2012 :
ALITHILA, EA 1061 - Analyse littéraires et histoire de la langue 
CALHISTE, EA 2444 - Cultures arts histoire imaginaires sociétés et territoires étrangers
CEAC, EA 3587 - Centre d’études des arts contemporains
CECILLE, EA 4074 - Centre d’études en civilisations, langues et lettres étrangères
CERAPS, UMR 8026 - Centre d’études et de recherches administratives, politiques et sociales
CeRIES, EA 3589 - Centre de Recherche "Individus, Épreuves, Sociétés"
CHJ, UMR 8025 - Centre d’histoire judiciaire
CIREL, EA 4354 - Centre universitaire de recherche en éducation de Lille
CLERSÉ, UMR 8019 - Centre lillois d’études et de recherches sociologiques et économiques
CREHS, EA 4027 - Centre de recherche et d’études - Histoire et sociétés
CURAPP-ESS, UMR 7319 - Centre universitaire de recherches administratives et politiques de Picardie
CRD&P, EA 4487 - Centre de recherche Droits et perspectives du droit
DYRT, EA 2468 - Dynamique des réseaux et des territoires
EQUIPPE, EA 4018 - Économie quantitative, intégration, politiques publiques et économétrie
ER3S, EA 4110 - Équipe de recherche septentrionale sports et sociétés
GERIICO, EA 4073 - Groupe d'études et de recherche interdisciplinaire en information et communication
GRAMMATICA, EA 4521 - Centre de recherche en linguistique française et en didactique du français
HALMA-IPEL, UMR 8164 - Histoire, archéologie, littérature des mondes anciens - Institut de papyrologie et d’égyptologie de Lille
HLLI, EA 4030 - Unité de recherche sur l’histoire, les langues, les littératures et l’interculturel
IRHiS, UMR 8529 - Institut de recherches historiques du Septentrion
LACTH - Laboratoire conception, territoire, histoire
LARJ, EA 3603 - Laboratoire de recherche juridique
LEM, UMR 8179 - Lille économie et management
DeVisu, EA 2445 - Design visuel et urbain
PERCOTEC, LAMIH - UMR 8530 - Équipe psychologie et ergonomie de la cognition dans les environnements technologiques
PSITEC, EA 4072 - Psychologie : interactions, temps, émotions, cognition
RECIFES, EA 4520 - Recherches en éducation, compétences, interactions, formations, éthique, savoirs
STL, UMR 8163 - Savoirs, textes, langage
Textes et cultures, EA 4028
TVES, EA 4477 - Territoires, villes, environnement et société
URECA, EA 1059 - Unité de recherche en sciences cognitives et affectives