L'axe transversal Épistémologie des sciences humaines et sociales, inhérent au programme scientifique de la MESHS, se structure autour de plusieurs dispositifs, évidemment tous ouverts à l'ensemble de la communauté scientifique (chercheurs/enseignants-chercheurs, doctorants, etc.) des laboratoires associés à la MESHS.
Parmi ceux-ci, se trouve la mise en place, depuis 2014, d'un séminaire d'épistémologie des sciences humaines et sociales, intitulé Les jeudis de l'épistémo. Il s'agit essentiellement d'un séminaire interne à la communauté scientifique de la MESHS. L'objectif de ce séminaire est d'initier et de développer une «communauté» de réflexion épistémologique, au-delà des initiatives intra et inter laboratoires déjà existantes. Expérimental et susceptible d'évoluer avec l'intelligence collective des participants, le format du séminaire est le suivant: un collègue se propose de traiter un thème à partir de deux textes (article, extrait d'ouvrage, etc.). Il s'agit de textes qui n'émanent pas de sa propre production mais qu'il considère comme importants. Sa présentation (40 minutes) est discutée par un autre collègue, puis suivie d'une reprise par un discutant et se conclut par un débat avec les participants. Les références des textes seront disponibles en amont des séances sur le site de la MESHS.
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